但在进行R ＆D 的来源结构比较时，又必须考虑不同的经济发展阶段，因为在经济发展的初期，科技发展更需要政府的关注和支持。据联合国关于工业发展阶段的划分，未来10年中国将处于从工业化1向工业化2迈进的阶段。从国际比较看，该阶段各国R ＆D 中的政府支出份额是很高的，到工业化后的阶段则是民间投入较多。
据《中国科技统计年鉴》数据进行国际比较，中国R ＆D 经费占GDP 的比重远低于80年代初期的发达国家，与中等收入国家也存在差距。特别是R ＆D 中的政府投入比例明显较小，90年代中期以来，政府投入比例逐年递减，1995年为50%，1997年降到26.2%.同年企业占到42.6%.值得指出的是，在中国现在所处的阶段，不能单纯与发达国家目前主要由企业进行R＆D 的情况相比，依赖企业的R ＆D 投入进行技术创新远远不够，政府必须承担更多的R ＆D 开支。
3.政府的公共卫生支出
新中国成立以后推行的"预防第一"的卫生战略，使城乡居民健康大为改善，被世界银行赞誉为"成功的卫生革命".然而随着改革的深入进行，旧有的医疗卫生供给的基本体系被废弃，城市经济改革削弱了国有企业社会福利提供者的角色；农村地方政府筹资困难，无力提供医疗服务，加深了不平等程度。2000年世界卫生组织对191个成员国医疗卫生公平性的评价中，中国排在到数第4位。
资料表明，中国的健康不平等主要存在于城乡之间。由于政府医疗卫生支出向城市倾斜，城市居民所享有的医疗卫生设施远远多于农民，导致城乡间的巨大差距。同时资料也显示医疗不平等具有地域性，富裕省份的平均健康结果较好。
诺贝尔经济学奖获得者Arrow 说过，卫生服务不同于一般的商品市场，政府的参与程度很高。政府的医疗卫生投入占GDP 的比重，发达国家一般在5－7%，中国只有2%.目前中国将政府医疗卫生支出的融资责任，下放到地方的基层县乡两级政府。由于县乡两级财政60%以上依靠上级政府的拨款，而教育和卫生支出又占两级财政支出的60%以上，在贫困地区甚至占到70%以上，因而地方基层政府的实际负担很大一部分落在老百姓的头上。如前面政府教育投入一样，将管理级次提高才能实现全国医疗卫生的起码的公平性。
专栏2地区间政府财力的差距
财政能力是用于测量某一地方政府为其服务提供资金的能力的指标。地区间社会基本服务的差距很大原因在于地区间财政能力存在较大的差距。中国各级政府间存在较高的纵向不平衡，由此带来了地方政府的财力缺乏，加重了各地的不平等程度。
1.中国财力分配的纵向不平衡
改革以来，政府间财力分配逐步演变为中央需要依赖地方政府征集收入后上解的状况。1985－1993年间，中央收入比重明显呈下滑趋势。1994年实行分税体制后，中央收入比重有了较大幅度的提高，地方政府开始接受中央财政拨款，普遍存在财政资金净流入现象（这里将税收返还作为中央对地方的拨款看待）。
（1）90年代末期地方政府收支缺口的比较分析表明，省级和县级政府的收支缺口最大，近一半需要通过获得上级政府的转移支付弥补（1998年分别是48.9%和47.1%）。地市级政府的收支缺口约为1／4（1998年是25.1%）。收支缺口最小的是乡镇政府，只占本级支出的2%左右。但典型调查证实，乡镇政府的不少收支活动在预算外进行，因此不能认为乡镇政府的收支缺口很小。
（2）在不同地区，同一级次政府的收支差异情况也有很大区别，因为省以下的转移支付制度是复杂和多样的。地区之间差异最大的是省级政府。图1显示，收支差额和经济发展水平有较强的相关性。乡镇一级虽然表现出更大的差异，同时与经济水平之间没有什么相关性。
2.地区间财政分配横向不平衡
目前地方政府间横向不平衡十分明显，财力水平差异悬殊，并且从动态分析看，省际人均财力呈逐年扩大趋势。
（1）各地方总人口人均财力绝对值高低悬殊，最高（3776.15元，2001年数据）与最低（262.57元）的省份相差超过十倍，反映了地方政府间提供公共服务能力差异过大。人均财力较高的省份主要分布在东部地区。低于全国平均水平的地区有两类：经济较发达但人口规模较大的省份和中西部农业省份。
（2）从地区间财力水平差异看，1988－1993年省际间的总人口人均总体差异系数呈递减态势，由1988年的0.57降至1993年的0.51；从1994年开始，这一指标又有差异增大的迹象，1994年为0.7，1996年0.74，1998年为0.81，1999年0.83.不仅超出1988年的水平，且呈现不断拉大的趋势。
（3）从省内不同地区看，东部地区省内的财力差异程度一般高于中西部地区。省会城市、沿海开放城市、开发区的财力水平普遍较高，计划单列市与所在省其他地区的财力差距更为悬殊。
（4）人均财政支出指标大致反映了各地实际可支配的预算内财政资源，相对真实地反映了地区间财政能力差异。测算结果表明：分税制改革后，地区间人均财政支出差距扩大。
1988年各地区人均财政支出相对差异系数为75.7%，1993年下降到67%，1994年上升到81.96%，2001年则扩大到85.95%.总体看来，上述地区间财力水平的差异，除了表明地区间经济发展水平不尽一致外，也说明现行分税体制没有触动往的地方既得利益，也没有将调节地区差异作为政策的主要政策目标，特别是规范的转移支付制度的建立滞后，是导致1994年以来地区差距拉大的重要原因。
专栏3转移支付制度：结构和分布
1.转移支付的结构问题
目前转移支付结构方面的问题，主要是专项拨款比重大（约占转移支付总额的1／5），均等化转移支付，特别是通过规范的公式方式分配的转移支付规模很小，在很大程度上照顾了分税制改革以前各地方的既得利益，不能有效发挥财力均等化的作用。
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